需要你看下变量里面具体的名称,这里只是示例哈,
names(p@top_annotation@anno_list)
names(p@left_annotation@anno_list)
Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...
需要你看下变量里面具体的名称,这里只是示例哈,
names(p@top_annotation@anno_list)
names(p@left_annotation@anno_list)
Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...
看报错的提示,是不是因为你的数据是多层数据?可能需要检查下数据的结构,看下是不是要先合并下
seurat V5升级:一些常见报错1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据,但是V3环境中导入V5环境会报错(缺依赖包)。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...
参考: https://docs.sylabs.io/guides/3.7/user-guide/environment_and_metadata.html[https://...
之前买的张丹的R极客理想的这本书想起来有R性能监控这部分的内容,学习了下。 1、Rprof 首先是R自带的Rprof包,不需要安装,直接导入即可 by.self: 这部分显示...
参考: https://www.asciitable.com/[https://www.asciitable.com/] https://xdays.me/%E5%A4%84...
这里我是使用的我另一篇文章中的function的方法,把代码加到环境变量中。 linux alias创建别名及创建带参数的别名(bash function[https://w...
1、查看本地文件编辑历史(可回退) 首先点击需要查看的文件,然后在File / Local History / Show History进行查看,可以看到自己编辑的历史,还可...
富集分析的常用包clusterProfiler,一般都是安装人和小鼠的数据库来进行分析注释。这篇文章将介绍一下非人鼠的物种如何安装目前支持的数据库。OrgDb目前有20个物种...
参考:https://satijalab.org/seurat/articles/seurat5_integration[https://satijalab.org/seur...
1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据,但是V3环境中导入V5环境会报错(缺依赖包)。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...
最近在研究seurat v5的数据处理。测试的时候发现使用seurat v5包对大数据进行sketch-based抽样分析之后,后续使用DotPLit进行绘图的时候会报错: ...
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My crochet designer软件绘制编织图解教程当【野生】织女们突然有个不错的idea的时候,往往也想像编织书里面一样记录一下自己的编织图解,但是不知道怎么上手。我在网上也查了很多资料,介绍绘制编织图解的文章的确凤毛麟角。...
1、CRAN来源包安装(install.packages) 这种方式是最常见的,可以一次安装一个包或者多个包: 有时候需要安装指定的版本,可以直接指定下载的url或者下载压缩...
My crochet designer软件绘制编织图解教程当【野生】织女们突然有个不错的idea的时候,往往也想像编织书里面一样记录一下自己的编织图解,但是不知道怎么上手。我在网上也查了很多资料,介绍绘制编织图解的文章的确凤毛麟角。...
桑基图在单细胞数据探索中的应用[//www.greatytc.com/p/a7a6b8b11e3c]热图在单细胞数据分析中的应用[https://www.jians...
嗯嗯,这里的width和height的设置其实可以看做是一个公式
Heatmap(mat, name = "mat",
width = ncol(mat)*unit(5, "mm"),
height = nrow(mat)*unit(5, "mm"))
参考截图中的设置,这里的5其实就是cellwidth和cellheight的大小,可以调整的
Complexheatmap::pheatmap图cell尺寸设置首先放出参考链接: https://jokergoo.github.io/2020/05/11/set-cell-width/height-in-the-heatmap/[h...
1、下载安装 2、加入环境变量及测试 3、结果使用 运行完成后会在脚本同路径下生成一个*.x和*.x.c,分别表示加密后的可执行文件和可执行文件的原文件(C语言)我们使用*....
cellranger在建库之前,有时候需要对GTF文件进行编辑修改。 比如为了后续在Seurat中使用正则匹配去除线粒体的基因,就需要修改原来GTF中的线粒体基因symbol...
参考链接: https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/5....