做完基因组注释后需要统计一下基因长度，CDS长度和intron以及exon长度。 1.首先统计基因数目，直接使用linux统计： awk '$3 == "gene"' mya...
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做完基因组注释后需要统计一下基因长度，CDS长度和intron以及exon长度。 1.首先统计基因数目，直接使用linux统计： awk '$3 == "gene"' mya...
背景介绍 verkko是一个最新的可以应用于二倍体基因组T2T（telomere-to-telomere）级别的基因组组装的组装软件。 2022年9月14号李恒在主题为Pac...
参考： 生信：2：sam格式文件解读[https://blog.csdn.net/genome_denovo/article/details/78712972]FastQ S...
首先是安装这个流程，试了一下可以使用conda进行安装 安装好以后很多perl脚本是在 anaconda3/envs/EVM/opt/evidencemodeler-2.1....
github链接 https://github.com/Gaius-Augustus/BRAKER[https://github.com/Gaius-Augustus/BRA...
gemoma是根据已知参考基因组的注释，给未知基因组注释的软件，貌似网上仅仅有提到，却没有具体的用法，笔者研究了一下，写下以下傻瓜式攻略，给大家参考安装很简单，直接用cond...
基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
