如何下载 NCBI NR NT数据库? 先了解BLAST Databases 1. Quick Start Get all numbered files for a data...
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1、Shortread aligners are designed to find regions of high similarity,当匹配的位置达到设定的阈值范围变不再...
1、Global alignments 全局比对:尽可能保证两条序列的碱基都能配对,因此会有比较多的错配和gap,但是不会对序列两端对gap进行罚分。 2、Local ali...
一、grep,以行为处理单位,当数据是多行折叠时,行之间存在换行符,在行尾与下行行首间的模式用grep不能匹配,这时可用dreg或fuzznuc,或者用tr -d '\n' ...
一、测序数据处理 1、bcl2fastq: converting the per-cycle base calls (stored in BCL files) into fa...
一、NCBI各类数据储存库 1、Sequence Read Archive (SRA):raw sequence data and alignment information...
NCBI数据库 NCBI编号的解释 AC:一些可供选择的注释的基因组序列,主要用来标记病毒和原核生物。 AP:AC标记对应的蛋白产物。 NC:完整的基因组分子序列,标...
一、使用帮助 1、Help:# help Command适用于内部命令;# Command --help/-h适用于外部命令。至于外部命令和内部命令的区分我们使用# type...
SET UP A MACos COMPUTER 一、首先分享几个在跟随书进行设置时出现的错误和解决办法: 1、xcodebuild This problem happens ...
浅谈生物信息学 伴随着互联网、大数据和人工智能的日益发展,计算机科学正成为当今世界上最重要的学科之一,与其相关的各类产业也在蓬勃发展。如果说计算机科学是当前最为热门的...