余绕

数据类型 输出结果

LiuYueRR

SnpEff使用方法 SnpEff 软件通过基因组结构注释数据（GTF文件），对VCF文件中的SNP/InDel信息进行注释，即主要解释了SNP/InDel是否能够对编码蛋白...

巩翔宇Ibrahimovic

GMAP最早用于讲EST/cDNA序列比对到参考基因组上，可以用于基因组结构注释。后来高通量测序时代，又开发了GSNAP支持高通量数据比对。 软件安装 我采用的是利用源代码且...

lakeseafly

Data preparation 继续上次的内容，下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下，下载好的数据。 基因组序列信息，存储基因组序列信息的.fasta文件。还有其...

屠夫_bc13

NR表示行；NF表示浏览文件域的个数（可以按列去理解）；注意$NF表示文件最后一个域

lakeseafly

前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...