活捉一只Sophie

选择1： 拿到测序下机数据，开始分析。首先创建目录 我是使用filezilla将公司给的原始数据上传到raw目录中。一共5个样品，其原始数据存在在以下5个目录中，结构如下： ...

xiaoguolaile

0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fastp[https://git...

胡童远

导读 Fastp能检测和去除adapter，PE序列overlap区碱基矫正，slide window修剪头尾，polyG/X尾修剪，UMI预处理。多功能合一，速度快，结果好...

不会生信

关于RNAseq Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这[https://app.yinxiang.com/fx/f8c7f63c-a05e-4ebf-...

shine_9457

写在前面参考1[https://cloud.tencent.com/developer/article/1625193]参考2[//www.greatytc.com...

思考问题的熊

还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA 下载自救尝试指南供你参考。 需要用到...

粥粥zz

一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...

刘小泽

刘小泽写于18.9.10实战上从数据下载到差异基因的获得、初步作图实战下进行富集分析，使用数据库进行注释在此感谢jimmy的limma包等教程 1 下载芯片数据 使用Fabb...